Научно-практический журнал "Ветеринарная патология" выпускается с 2002 года. Первым редактором издания была Светлана Гойденко, первым председателем редакционного совета — известный российский вирусолог и эпизоотолог Владимир Владимирович Макаров. Наравне с журналом редакция верстала еженедельную газету «Ветеринарный консультант», которая, кроме сугубо ветеринарных аспектов, занималась проблемами функционирования ветеринарной службы, нормативно-правовыми вопросами, вопросами юридической защиты ветеринарных врачей, задачами профсоюзного движения в ветеринарии.
Первый номер «Ветеринарной патологии» был всецело посвящен бешенству как зоонозу. Это и послужило предтечей ведущего направления журнала — болезни, общие для человека и животных.
Журнал «Ветеринарная патология» и журнал «Ветеринария» после развала Советского Союза оставались единственными научными изданиями, посвященными исключительно вопросам ветеринарной медицины.
С 2009 года журнал возглавляет доктор биологических наук, профессор Ермаков Алексей Михайлович. Заместителем главного редактора является доктор биологических наук Аксёнова Полина Владимировна.
В 2011 году журнал стал рецензируемым научным органом, в котором публиковались результаты диссертаций, представленных к защите в диссертационных советах по ветеринарным, биологическим и сельскохозяйственным наукам.
С первого национального, а затем и международного симпозиума «Единое здоровье» журнал систематически, последовательно и настойчиво поддерживал и развивал идею единой научной платформы для общения медиков, биологов и ветеринарных врачей в совместном противостоянии биологическим угрозам в условиях современного мира.
Журнал выступил с инициативой восстановить почетное звание «Заслуженный ветеринарный врач Российской Федерации», несправедливо исключённое из государственной наградной системы в 2010 году. Чтобы добиться результата, коллектив журнала в течение длительного времени собирал подписи, составлял петиции, поднимал вопрос на отраслевых совещаниях.
Главный редактор лично обращался к Президенту Владимиру Владимировичу Путину во время его визита в город Ростов-на-Дону. Благодаря общим усилиям неравнодушных представителей ветеринарных сообществ, в 2021 году вышел Указ № 280 Президента Российской Федерации от 17 мая о восстановлении звания.
В журнале печатались такие мэтры ветеринарной медицины, как профессор Ведерников Виктор Алексеевич, академик Гулюкин Михаил Иванович, профессор Макаров Владимир Владимирович, профессор Сочнев Василий Васильевич.
Постоянным автором журнала был эпизоотолог с мировым именем, автор «Теории эпизоотического процесса» Симон Иванович Джупина. Его статьи «Сибирская язва и догмы в изучении её эпизоотического процесса», «Роль l-формы бактерий в эпизоотическом процессе болезней продуктивных животных», «Экология — фундаментальная основа эпизоотического процесса», цикл ярчайших работ по эпизоотологии сибирской язвы, бруцеллёза, туберкулёза, лейкоза, болезни Ньюкасла, пастереллёза и геморрагической септицемии были украшением многих выпусков издания «Ветеринарная патология».