ВИДОВАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ КЛЕТОЧНЫХ ЛИНИЙ МЛЕКОПИТАЮЩИХ ВЫСОЧУВСТВИТЕЛЬНЫМИ МЕТОДАМИ АНАЛИЗА ДНК
Аннотация
Aiming at identification of tissue and species origin of mammalian cell lines collected at Ivanovsky Institute
of Virology, Russian Academy of Medical Sciences, we analyzed 31 cell lines initially isolated in the institute
or donated by collaborators. The species-specific polymerase chain reaction and direct sequencing of mitochondrial
DNA demonstrated that in 5 cases the species origin of the cell line has been misinterpreted. The
detailed protocols of the techniques used for DNA-based species identification are presented.
of Virology, Russian Academy of Medical Sciences, we analyzed 31 cell lines initially isolated in the institute
or donated by collaborators. The species-specific polymerase chain reaction and direct sequencing of mitochondrial
DNA demonstrated that in 5 cases the species origin of the cell line has been misinterpreted. The
detailed protocols of the techniques used for DNA-based species identification are presented.
Об авторах
К. В. Кулешов
ВНИИ экспериментальной ветеринарии им. Я.Р. Коваленко РАСХН (ВИЭВ)
Россия
Россия
О. М. Гринкевич
Россия
Р. Я. Подчерняева
Россия
Л. П. Дьяконов
Россия
Список литературы
1. Новохатский, А.С., Михайлова, Г.Р. и Царева, А.А. (1976) 'Проблема контаминации клетками и новые подходы к контролю перевиваемых линий', Вопросы вирусологии, С. 396-408.
2. Новохатский, А.С., Царева, А.А., Михайлова, Г.Р. и Жданов, В.М. (1979) 'Контаминация клеток перевиваемых линий', Вопросы вирусологии, С. 432-439.
3. Царева, А.А., Колокольцова, Т.Д., Немцов, Ю.В., Исаенко, А.А. и Бочкова, Т.Г. (1986) 'Идентификация линий клеток насекомых', Вопросы вирусологии, С. 87-95.
4. Armstrong, K.F. and Ball, S.L. (2005) 'DNA barcodes for biosecurity: invasive species identification', Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Vol. 360, No. 1462, С. 1813-1823.
5. Buehring, G.C., Eby, E.A. and Eby, M.J. (2004) 'Cell line cross-contamination: how aware are Mammalian cell culturists of the problem and how to monitor it?', In Vitro Cell Dev Biol Anim, Vol. 40, No. 7, pp. 211-5.
6. Gartler, S.M. (1968) 'Apparent Hela cell contamination of human heteroploid cell lines', Nature, Vol. 217, No. 5130, pp. 750-1.
7. Gilbert, D.A., Reid, Y.A., Gail, M.H., Pee, D., White, C., Hay, R.J. and O'Brien, S.J. (1990) 'Application of DNA fingerprints for cell-line individualization', Am J Hum Genet, Vol. 47, No. 3, pp. 499-514.
8. Hebert, P.D. and Gregory, T.R. (2005) 'The promise of DNA barcoding for taxonomy', Syst Biol, Vol. 54, No. 5, pp. 852-9.
9. Irwin, D.M., Kocher, T.D. and Wilson, A.C. (1991) 'Evolution of the cytochrome b gene of mammals', J Mol Evol, Vol. 32, No. 2, pp. 128-44.
10. Kaplan, J. and Hukku, B. (1998) 'Cell line characterization and authentication', Methods Cell Biol, Vol. 57, pp. 203-16.
11. Natalia V. Ivanova (2007) 'Universal primer cocktails for fish DNA barcoding', Molecular Ecology Notes, Vol. 7, No. 4, pp. 544-548.
12. Ratnasingham, S. and Hebert, P.D.N. (2007) '- bold: The Barcode of Life Data System ( http://www.barcodinglife. org)', Vol. - 7, pp. - 364.
13. Saitou, N. and Nei, M. (1987) 'The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees', Mol Biol Evol, Vol. 4, No. 4, pp. 406-25.
14. Simpson, W.F. and Stulberg, C.S. (1963) 'Species Identification of Animal Cell Strains by Immunofluorescence', Nature, Vol. 199, pp. 616-7.
15. Stulberg, C.S., Simpson, W.F. and Berman, L. (1961) 'Species-related antigens of mammalian cell strains as determined by immunofluorescence', Proc Soc Exp Biol Med, Vol. 108, pp. 434-9.
16. Tamura, K., Dudley, J., Nei, M. and Kumar, S. (2007) 'MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0', Mol Biol Evol, Vol. 24, No. 8, pp. 1596-9.
Рецензия
Для цитирования:
Кулешов К.В., Гринкевич О.М., Подчерняева Р.Я., Дьяконов Л.П. ВИДОВАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ КЛЕТОЧНЫХ ЛИНИЙ МЛЕКОПИТАЮЩИХ ВЫСОЧУВСТВИТЕЛЬНЫМИ МЕТОДАМИ АНАЛИЗА ДНК. Ветеринарная патология. 2009;30(3):28-33.
Просмотров:
40
Послать статью по эл. почте 