ОПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНОТИПИЧЕСКОЙ ПРИНАДЛЕЖНОСТИ ИЗОЛЯТОВ ВИРУСА НЬЮКАСЛСКОЙ БОЛЕЗНИ, ВЫЯВЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2006 ГОДУ
Аннотация
Проведен генетический анализ 9 изолятов вируса ньюкаслской болезни (ВНБ), выявленных у до-
машних и синантропных птиц из разных регионов Российской Федерации в 2006 г. Использовали
ПЦР с последующим секвенированием и сравнительным анализом нуклеотидных последователь-
ностей главной функциональной области гена F. Последовательность сайта расщепления F1/F2 всех
изолятов была типичной для вирулентных парамиксовирусов птиц серотипа 1. Сайт расщепления
F1/F2 большинства изолятов имел последовательность 112RRQKRF117, также встречались последо-
вательности 112KRQKRF117, 112RRRKRF117, 112RRKKRF117, 112KRKKRF117. С использованием последо-
вательностей фрагментов гена F длиной 200 н. исследованных изолятов и референтных штаммов
ВНБ, полученных из GenBank, построили филогенетическое дерево. Филогенетический анализ по-
казал, что все вновь охарактеризованные изоляты относятся к четырем подгруппам двух генотипов:
4а(VIa), 4а(VIb/2), 4b(VIb), 5d(VIId).
машних и синантропных птиц из разных регионов Российской Федерации в 2006 г. Использовали
ПЦР с последующим секвенированием и сравнительным анализом нуклеотидных последователь-
ностей главной функциональной области гена F. Последовательность сайта расщепления F1/F2 всех
изолятов была типичной для вирулентных парамиксовирусов птиц серотипа 1. Сайт расщепления
F1/F2 большинства изолятов имел последовательность 112RRQKRF117, также встречались последо-
вательности 112KRQKRF117, 112RRRKRF117, 112RRKKRF117, 112KRKKRF117. С использованием последо-
вательностей фрагментов гена F длиной 200 н. исследованных изолятов и референтных штаммов
ВНБ, полученных из GenBank, построили филогенетическое дерево. Филогенетический анализ по-
казал, что все вновь охарактеризованные изоляты относятся к четырем подгруппам двух генотипов:
4а(VIa), 4а(VIb/2), 4b(VIb), 5d(VIId).
Об авторах
И. П. ПчелкинаРоссия
С. Н. Колосов
Россия
Т. Б. Манин
Россия
И. А. Чвала
Россия
Л. О. Щербакова
Россия
С. К. Старов
Россия
В. В. Дрыгин
Россия
Список литературы
1. A longitudinal study of velogenic Newcastle disease virus genotypes isolated in Italy between 1960 and 2000 / J. Herczeg, S. Pascucci, P. Massi [et al.] // Avian Pathol. 2001. Vol. 30. P. 163-168
2. A molecular epidemiological study of avian paramyxovirus type 1 (Newcastle disease virus) isolates by phylogenetic analysis a partial nucleotide sequence of fusion protein gene / E.W. Aldous, J.K. Mynn, J. Banks, D.J Alexander // Avian Pathol. 2003. Vol. 32, № 3. P. 239-257.
3. A molecular epidemiological investigation of isolates of the variant avian paramyxovirus type 1 virus (PPMV-1) responsible for the 1978 to present panzootic in pigeons / E.W. Aldous, C.M. Fuller, J.K. Mynn, D.J. Alexander // Avian Pathol. 2004. Vol. 33, № 2. P. 258-269.
4. An outbreak of Newcastle disease in pheasants in Great Britain in May 1996 / D.J. Alexander, R.J. Manvell, K.M. Frost [et al.] // Vet. Rec. 1997. Vol. 140. P. 20-22.
5. Antigenic and genetic characterisation of Newcastle disease viruses isolated from outbreaks in domestic fowl and turkeys in Great Britain during 1997 / D.J. Alexander, J. Banks, M.S. Collins [et al.] // Vet. Rec. 1999. Vol. 145. P. 417-421.
6. Antigenic diversity and similarities detected in avian paramyxovirus type 1 (Newcastle disease virus) isolates using monoclonal antibodies / D.J. Alexander, R.J. Manwell, J.P. Lowings [et al.] // Avian Pathol. 1997. Vol. 26. P. 399-418.
7. Antigenic and phylogenetic studies on a variant Newcastle disease virus using anti-fusion protein monoclonal antibodies and partial sequencing of the fusion protein gene / M.S. Collins, S. Franklin, I. Strong [et al.] // Avian Pathol. 1998. Vol. 27. P. 90-96
8. Avian paramyxovirus type 1 infection of racing pi geons: 3. Epizootiological considerations / D.J. Alexander, G.W. Wilson, J.A. Thain, S.A. Lister // Vet. Rec. 1984 c. Vol. 115. P. 213-216.
9. Characterization of Newcastle disease virus isolates by reverse transcription PCR coupled to direct nucleotide sequencing and development of sequence database for pathotype prediction and molecular epidemiological analysis / B.S. Seal, D.J. King, J.D. Bennett [et al.] // J. Clin. Microbiol. 1995. Vol. 33. P. 2624-2630.
10. Characterization of Newcastle disease viruses isolated in Italy in 2000 / G. Cattoli, R.J. Manvell, E. Tisato [et al.] // Avian Pathol. 2001. Vol. 30. P. 465-469.
11. Characterization of newly emerging Newcastle disease virus isolates from the peoples Republic of China and Taiwan / L. Yu, Z.L. Wang, L. Chang [et al.] // J. Clin. Microbiol. 2001. Vol. 39. P. 3512-3519.
12. Collins, M.S. Pathogenicity and phylogenetic evaluation of the variant Newcastle disease viruses termed pigeon PMV-1 viruses based on the nucleotide sequences of the fusion protein gene / M.S. Collins, I. Strong, D.J. Alexander // Arch. Virol. 1996. Vol. 141. P. 635-647.
13. Identification grouping of Newcastle disease virus strains by restriction site analysis of a region from the F gene / A. Ballagi-Pordany, E. Wehmann, J. Herczeg [et al.] // Arch. Virol. 1996. Vol. 141. P. 243-261.
14. Kaleta, E.F. The first isolation of the avian PMV- 1 virus responsible for the current panzootic in pigeons? / E.F. Kaleta, D.J Alexander, P.H. Russell // Avian Pathol. 1985. Vol. 14. P. 553-557.
15. Lamb, R.A. Paramyxoviridae: the viruses and their replication / R. A. Lamb, D. Kolakofsky // Fundamental Virology Lippincott-Raven Publishers, Philadelphia, 2002. P. 1305-1340.
16. Mayo, M. A. Virus Taxonomy-Houston 2002 / M.A. Mayo // Arch. Virol. 2002. Vol. 147. P. 1071-1076.
17. Molecular epidemiological analysis of Newcastle disease virus isolated in China in 2005 / H. Liu, Z. Wang, Y. Wu [et al.] // J. Virol. Meth. 2006. Vol.140. P. 206-211.
18. Newcastle disease // O.I.E. Manual of Standards for Diagnostic Tests and Vaccines, 2005. http://www.oie. int/eng/normes/mmanual/A_00038.htm
19. Newcastle disease virus evolution. 2. Lack of gene recombination in generating virulent and avirulent stains / T. Toyoda, T. Sakaguchi, H. Hirota [et al.] // Virology. 1989. Vol. 169. P. 273-282.
20. Newcastle disease virus isolated from recent outbreaks in Taiwan phylogenetically related to viruses (Genotype VII) from recent outbreaks in Western Europe / C.Y. Yang, H. K. Shieh, Y.L. Lin [et al.] // Avian Dis. 1999. Vol. 43. P. 125-130.
21. Newcastle disease outbreaks in recent years in Western Europe were caused by an old (VI) and novel genotype (VII) / B. Lomniczi, E. Wehmann, J. Herczeg [et al.] // Arch. Virol. 1998. Vol. 143. P. 49-64.
22. Phylogenetic analysis reveals extensive evolution of avian paramyxovirus type 1 strains of pigeons (Columba livia) and suggests multiple species transmission / D. Ujvari, E. Wehmann, E. F. Kaleta [et al.] // Virus Research. 2003. Vol. 96. P. 63-73.
23. Seal, B.S. Analysis of matrix protein gene nucleotide sequence diversity among Newcastle disease virus isolates demonstrates that recent disease outbreaks are caused by viruses of psittacine origin / B.S. Seal // Virus Genes. 1996. Vol. 11. P. 217-224.
24. Structural comparison of the cleavage-activation site of the fusion glycoprotein between virulent and avirulent strains of Newcastle disease virus / T. Toyoda, T. Sakaguchi, K. Imal [et al.] // Virology. 1987. Vol. 158. P. 242-247.
25. Two novel genetic groups (VIIb and VIII) responsible for recent Newcastle disease outbreaks in Southern Africa, one (VIIb) of which reached Southern Europe // J. Herczeg, E. Wehmann, R.R. Bragg [et al.] // Arch. Virol. 1999. Vol. 144. P. 2087-2099.
Рецензия
Для цитирования:
Пчелкина И.П., Колосов С.Н., Манин Т.Б., Чвала И.А., Щербакова Л.О., Старов С.К., Дрыгин В.В. ОПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНОТИПИЧЕСКОЙ ПРИНАДЛЕЖНОСТИ ИЗОЛЯТОВ ВИРУСА НЬЮКАСЛСКОЙ БОЛЕЗНИ, ВЫЯВЛЕННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2006 ГОДУ. Ветеринарная патология. 2007;(4):162-167.
Просмотров:
44
Послать статью по эл. почте 